Mother kuvaa seitsemää ratkaisevaa päivää vuonna 1948, jolloin abbedissa Teresa (Noomi Rapace) odottaa Vatikaanin lupaa lähteä Intiassa sijaitsevasta luostaristaan aloittaakseen oman lähetystyönsä. Samaan aikaan hän saa järkyttävän uutisen sisar Agnieszkalta, oletetulta seuraajaltaan luostarissa.